Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHKA1P46020 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms