Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCAMP43121 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCAMP43121 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCAMP43121 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCAMP43121 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCAMP43121 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCAMP43121 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCAMP43121 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms