Protein–RNA interactions for Protein: P41217

CD200, OX-2 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD200P41217 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD200P41217 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD200P41217 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD200P41217 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms