Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPGP40121 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPGP40121 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPGP40121 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPGP40121 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPGP40121 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPGP40121 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPGP40121 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPGP40121 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPGP40121 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPGP40121 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAPGP40121 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAPGP40121 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAPGP40121 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPGP40121 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms