Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZEB1P37275 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms