Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP62P37198 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP62P37198 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP62P37198 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms