Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX11P35716 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX11P35716 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX11P35716 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX11P35716 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX11P35716 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX11P35716 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms