Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms