Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA10P31260 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA10P31260 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms