Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms