Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJB2P29033 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB2P29033 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB2P29033 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB2P29033 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms