Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RXRBP28702 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RXRBP28702 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RXRBP28702 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RXRBP28702 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRBP28702 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRBP28702 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRBP28702 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRBP28702 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RXRBP28702 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms