Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms