Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PLNP26678 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms