Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms