Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms