Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms