Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GATA1P15976 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GATA1P15976 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GATA1P15976 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GATA1P15976 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GATA1P15976 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GATA1P15976 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GATA1P15976 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GATA1P15976 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GATA1P15976 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GATA1P15976 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GATA1P15976 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GATA1P15976 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GATA1P15976 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GATA1P15976 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms