Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms