Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms