Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L5P0DN76 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms