Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGA3P0DJD8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms