Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms