Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms