Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEFMP07197 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEFMP07197 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEFMP07197 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NEFMP07197 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEFMP07197 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEFMP07197 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFMP07197 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms