Protein–RNA interactions for Protein: P04234

CD3D, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3DP04234 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD3DP04234 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms