Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD74P04233 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD74P04233 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms