Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINC1P01008 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINC1P01008 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms