Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POP4O95707 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POP4O95707 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POP4O95707 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms