Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG12O94817 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG12O94817 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG12O94817 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG12O94817 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms