Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms