Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms