Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN5O75503 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN5O75503 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms