Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F6O75461 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms