Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG13O75143 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG13O75143 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATG13O75143 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms