Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIAA0556O60303 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms