Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DENRO43583 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DENRO43583 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DENRO43583 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DENRO43583 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DENRO43583 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DENRO43583 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DENRO43583 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DENRO43583 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DENRO43583 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DENRO43583 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DENRO43583 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DENRO43583 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DENRO43583 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DENRO43583 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DENRO43583 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DENRO43583 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DENRO43583 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DENRO43583 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DENRO43583 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DENRO43583 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DENRO43583 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DENRO43583 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DENRO43583 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms