Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms