Protein–RNA interactions for Protein: O15444

CCL25, C-C motif chemokine 25, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25O15444 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCL25O15444 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms