Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPATO15228 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPATO15228 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPATO15228 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPATO15228 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPATO15228 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms