Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3AO14802 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR3AO14802 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR3AO14802 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms