Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms