Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NPIPB9F8W1W9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms