Protein–RNA interactions for Protein: C9JVG2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9JVG2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9JVG2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9JVG2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9JVG2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9JVG2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9JVG2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9JVG2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9JVG2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9JVG2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9JVG2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9JVG2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9JVG2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9JVG2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms