Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms