Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L4A6NEF3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms