Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX10Q9Y5X0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX10Q9Y5X0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX10Q9Y5X0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX10Q9Y5X0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms