Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITM2BQ9Y287 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITM2BQ9Y287 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2BQ9Y287 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITM2BQ9Y287 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms