Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM2Q9UQ35 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRRM2Q9UQ35 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRRM2Q9UQ35 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRRM2Q9UQ35 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRRM2Q9UQ35 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRRM2Q9UQ35 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRRM2Q9UQ35 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRRM2Q9UQ35 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRRM2Q9UQ35 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRRM2Q9UQ35 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRRM2Q9UQ35 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms