Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SATB2Q9UPW6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SATB2Q9UPW6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SATB2Q9UPW6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms